Исследование для выявления серотипов 40 и 41 аденовируса, в ходе которого с помощью метода полимеразной цепной реакции в реальном времени (РТ-ПЦР) определяется генетический материал (ДНК) вируса в кале.
Синонимы русские
Аденовирус, серотипы F40/F41 [Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени].
Синонимы английские
Group F adenovirus, AdV, HAd V [Real-Time Polymerase Chain Reaction, quantitative, RT-PCR, qPCR, qRT-PCR.
Метод исследования
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.
Какой биоматериал можно использовать для исследования?
Кал.Общая информация об исследовании
Аденовирус – это безоболочечный ДНКсодержащий вирус, принадлежащий к семейству Adenoviridae. В зависимости от таких характеристик, как структура гемагглютинина, длина гена фибера и количество GC-пар в геноме, различают 68 серотипов аденовируса, объединенных в 7 групп (7 видов): A-G.
Аденовирус является возбудителем широкого спектра заболеваний человека, включая ОРВИ, конъюнктивит, геморрагический цистит и гастроэнтерит. Аденовирус – причина 4-12 % случаев вирусного гастроэнтерита. Это второе место по частоте (первое место – ротавирус). Наиболее часто аденовирусная кишечная инфекция наблюдается у детей в возрасте до 2 лет, однако также могут болеть подростки и взрослые люди. Хотя чаще заболевание имеет благоприятный прогноз, аденовирусная инфекция может принять тяжелое течение, особенно у людей с пониженным иммунитетом (состояние после трансплантации аутологичных стволовых клеток, СПИД). Разные серотипы ассоциированы с разными клиническими признаками инфекции. Так, например, серотипы C1 и B7 часто обнаруживаются при ОРВИ, тогда как серотипы F40 и F41 – при гастроэнтерите (кишечные типы вируса). Более того, показано, что разные серотипы аденовируса могут по-разному отвечать на противовирусные препараты. Учитывая эти особенности, крайне желательно идентифицировать видовую принадлежность аденовируса и его серотип.
Для диагностики аденовирусной инфекции могут быть использованы следующие методы:

Электронная микроскопия. Этот метод может быть использован для идентификации практически всех кишечных вирусов в одном образце кала. Он, однако, сложный и недостаточно чувствительный (необходимо по крайней мере 106 интактных вирусных частиц/мл кала).
Выделение вируса в культуре клеток. Хотя этот метод считается "золотым стандартом" диагностики большинства вирусных инфекций, в том числе и аденовируса, известно, что выделить серотипы F40 и F41 особенно сложно. Кроме того, для выделения вируса в культуре обычно требуется несколько дней.
Выявление антигена аденовируса с помощью иммуноферментного анализа (ИФА) или латекс-агглютинации. Это быстрые и удобные тесты, которые используются в качестве скрининга. Они имеют высокую специфичность, но, к сожалению, недостаточную чувствительность.
Методы молекулярной диагностики: полимеразная цепная реакция (ПЦР) и ее разновидность – ПЦР в реальном времени (РТ-ПЦР).

РТ-ПЦР – метод молекулярной диагностики, позволяющий выявлять в биологическом материале (например, в кале) фрагменты генетического материала ДНК аденовируса. РТ-ПЦР обладает несколькими преимуществами по сравнению с другими методами диагностики аденовирусной инфекции:

Высокая чувствительность исследования. Теоретически для осуществления этой реакции достаточно всего 1 молекулы ДНК. На практике, однако, требуется около 10-1000 молекул. Также важно, что для осуществления реакции достаточно фрагментов ДНК, а не живого микроорганизма. Это имеет особое значение, если сдача кала для анализа производится уже на фоне начатой терапии противовирусными препаратами.
Высокая специфичность исследования. Так как в реакции используются праймеры, специфические именно к серотипам F40/F41, метод позволяет четко идентифицировать не только видовую принадлежность аденовируса, но и его серотип.
Метод РТ-ПЦР также позволяет оценить вирусную нагрузку в образце кала, что имеет наибольшее значение для эпидемиологов.

Следует отметить некоторые ограничения метода РТ-ПЦР:

Исследование не может быть использовано для контроля лечения: результат анализа будет оставаться положительным (ложноположительным) еще в течение некоторого времени после начала лечения, даже если оно эффективно.
Чувствительность РТ-ПЦР в меньшей степени, чем культурологического метода, подвержена влиянию противовирусных препаратов. Однако максимально точный результат теста будет получен при анализе кала, полученного до начала лечения.

Результат исследования оценивается с учетом анамнестических, клинических и других лабораторных данных.
Для чего используется исследование?

Для диагностики гастроэнтерита.

Когда назначается исследование?

При наличии тошноты, рвоты, диареи, боли в животе, лихорадки, особенно у детей в возрасте до 2 лет.
Что означают результаты?
Референсные значения: не обнаружено.  Положительный результат:

аденовирусная инфекция.

Отрицательный результат:

норма.

Что может влиять на результат?

Применение противовирусных препаратов (цидофовир, рибавирин).